ปฏิกรณ์ชีวภาพ หมายถึงอุปกรณ์หรือระบบที่สร้างสภาพแวดล้อมที่เหมาะสมในการตื่นตัวทางชีวภาพ ในบางกรณีก็อาจหมายความถึงถังที่มีการทำปฏิกิริยาเคมีกับสิ่งมีชีวิตหรือชีวเคมีที่ได้จากสิ่งมีชีวิตนั้น โดยอาศัยการให้อาหารและควบคุมสภาพแวดล้อมที่เหมาะสมต่อการเจริญเติบโตฯ ซึ่งกระบวนการนั้นอาจทำได้โดยใช้สิ่งมีชีวิตที่ต้องการออกซิเจนหรือสิ่งมีชีวิตที่ไม่ต้องการออกซิเจนก็ได้ อุปกรณ์ปฏิกรณ์ชีวภาพโดยทั่วไปจะมีทรงกระบอก มีขนาดตั้งแต่หน่วยเป็นลิตรถึงลูกบาศก์เมตรก็ได้ และมักทำด้วยเหล็กกล้าไร้สนิม
นอกจากนี้ยังอาจหมายถึงอุปกรณ์หรือระบบที่ออกแบบมาเพื่อทำให้เซลล์หรือเนื้อเยื่อเจริญเติบโตในรูปแบบของการเพาะเลี้ยงเซลล์ อุปกรณ์เหล่านี้มักนำไปใช้เพื่อการสังเคราะห์เนื้อเยื่อหรือการวิศวกรรมชีวภาพ