ไมโครไบโอมของมนุษย์

Graphic depicting the human skin microbiota, with relative prevalences of various classes of bacteria

ในร่างกายมนุษย์มีชุมชนจุลชีพ (ไมโครไบโอตา) อาศัยอยู่เป็นปกติ จุลชีพทั้งหมดในร่างกายมนุษย์คนหนึ่งๆ เรียกรวมว่า ไมโครไบโอมของมนุษย์ (อังกฤษ: microbiome, human microbiome) โดยนับรวมทั้งที่อยู่บนผิว ภายในเนื้อเยื่อ หรือในสารคัดหลั่งของอวัยวะต่างๆ ได้แก่ ผิวหนัง ต่อมน้ำนม รก น้ำอสุจิ มดลูก รังไข่ ปอด น้ำลาย เยื่อบุช่องปาก เยื่อบุตา ท่อน้ำดี และทางเดินอาหาร สิ่งมีชีวิตเหล่านี้มีทั้งที่เป็นแบคทีเรีย อาร์เคีย เชื้อรา โปรติสต์ และไวรัส นอกจากนี้ยังอาจมีสัตว์ขนาดเล็กอาศัยอยู่ในร่างกายมนุษย์ แต่มักไม่นับรวมเป็นส่วนหนึ่งของไมโครไบโอม บางครั้งอาจมีการใช้คำว่า "ไมโครไบโอม" ในอีกความหมายหนึ่ง คือหมายถึงพันธุกรรมรวมทั้งหมด หรือ จีโนม ของทั้งมนุษย์และสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กเหล่านี้รวมกัน อีกคำหนึ่งที่มีความหมายเดียวกันคือ human metagenome